Bolojan a găsit Fondul Naţional Unic de Asigurări Sociale de Sănătate (FNUASS) din care e finanţat în mare parte sistemul asigurărilor sociale de sănătate cu deficit de 3,5 miliarde de lei în primele patru luni din 2025. La preluarea conducerii guvernului, Fondul Sănătăţii a fost finanţat de circa 6,1 milioane de salariaţi şi de persoane fizice care plăteau CASS plafonată prin declaraţia unică, precum şi de taxa clawback plătită de deţinătorii de autorizaţie de punere pe piaţă a medicamentelor, care susţineau tot sistemul asigurărilor sociale de sănătate format dintr-un bazin de 16 milioane de asiguraţi. Bolojan lasă în urma sa un deficit la FNUASS de circa 506 milioane de lei în primul trimestru al anului 2026, de peste cinci ori mai mic decât cel cu care a încheiat primele trei luni ale anului 2025, şi un bazin de plătitori de CASS extins cu cel puţin 2,6 milioane de oameni. Bolojan a reuşit să elimine categoria de coasigurat, măsura nepopulară evitată sistematic de toate guvernele anterioare, dar necesară şi dorită de tehnocraţii din sistemul sanitar. Bolojan a adus prin Legea 141 din 2025 cele mai profunde schimbări în finanţarea sistemului asigurărilor sociale de sănătate de la înfiinţarea CNAS, în anul 1999.